永磁變頻空壓機的缺點主要包括以下幾點：

　　含油分問題：對于噴油永磁變頻空壓機，其壓縮空氣中含有油分，這在食品工業等特定行業中可能不適用，因為油分可能污染產品。

　　轉子卡住現象：在長期運轉后停機，噴油永磁變頻空壓機內的轉子可能會因為潤滑油中雜質沉淀結油垢而卡住，這影響了空壓機的可靠性和備用狀態。

　　壽命和換機成本高：無油永磁變頻空壓機的本體壽命相對較短，通常僅有3-5年。此外，更換整組空壓機本體的成本往往超過購置新機的六成，這增加了使用成本。

　　氣密性不佳：無油永磁變頻空壓機中，陰、陽螺桿之間必須存在的間隙可能導致氣密性不甚理想，這是其能源效率不佳的一個主要原因。

　　怕退磁：永磁變頻空壓機使用的電機是永磁電機，這種電機存在退磁的風險。特別是當電機長時間處于高溫狀態時，容易發生退磁。

　　維護相對麻煩：與普通壓縮機相比，永磁變頻機的維護更為復雜。在機頭的維護過程中，需要拆卸電機，且必須使用專業工具，因為轉子具有很強的吸引力。這要求維護人員具備專業技能。

　　制造成本高：由于永磁同步電機本身技術要求較高，使得永磁變頻空壓機的制造成本相對較高。這也導致了其市場價格偏高于傳統空壓機。

　　維修成本高：雖然永磁同步電機的故障率較低，但一旦發生故障，其修理和維護成本會相對較高。這要求維修人員具備專業的知識和技能。

　　綜上所述，永磁變頻空壓機雖然具有高效、節能環保等優點，但在選擇使用時也需要權衡其缺點，并根據具體需求來確定是否適合采用。